Génomique et Transcriptomique

Solution BioSinc et Biomic

En complément des tests réglementaires (PL, REACH), les LPLs proposent une méthode innovante pour mettre en évidence la biodégradabilité d’une molécule par des communautés bactériennes via des outils de biologie moléculaire.

illustration Laboratoires des Pyrénées et des Landes (LPL)

la solution BioSinc


En s’appuyant sur la technique du séquençage du gène de l’ARNr16S, les équipes peuvent évaluer la biomasse bactérienne au cours de l’étude de biodégradabilité et définir les communautés bactériennes présentes à chaque temps de l’étude (séquençage de l’ADN) ainsi que les communautés métaboliquement actives (séquençage de l’ARN). Cette méthode novatrice permet de comprendre le devenir d’une molécule dans le temps. Les LPLs délivrent à terme un rapport d’étude complet corrélant les méthodes d’analyse réglementaires et les résultats de biologie moléculaire avec le rôle de chaque communauté bactérienne dans la dégradation de la molécule.

Biomic, la génomique au service de la surveillance environnementale


Lors du projet de recherche européen INTERREG SUDOE, les LPLs ont apporté leur contribution scientifique et technique pour l’élaboration d’un prototype Bioindicateurs microbiens et trophiques de l’état écologique de l’écosystème en zone côtière du SUDOE.

En s’appuyant sur la technique du séquençage des gènes de l’ARNr16S et de l’ARNr18S, l’objectif était de déterminer la présence de communautés bactériennes précises et adaptés à des conditions environnementales dégradés ou non. L’objectif était de développer un outil de diagnostic de la qualité de l’écosystème dans les zones côtières de l’espace SUDOE, donc Espagne, France et Portugal.

Projet Biomic (2020-2023) : Bioindicateurs microbiens et trophiques de l’état écologique de l’écosystème en zone côtière du SUDOE. Finance par INTERREG SUDOE le projet a été réalisé en partenariat avec l’Université de Pau et des Pays de l’Adour, l’Université de La Rochelle, l’Universitat de les Illes Balears, l’Universidade do Porto, PARALAB SA, la Fundacion Pública Andaluza Centro de las nuevas Tecnologias del Agua, Aquitaine Science Transfert, l’Union des marais de la Charente Maritime, la Mancomunidad de Municipios Sostenibles de Cantabria, la Diputación Provincial de Huelva ainsi que les partenaires associés de la Consejeria de desarrollo rural, ganadería, pesca, alimentación y medio ambiente del gobierno de Cantabria España, la DG Espacios Naturales y Biodiversidad, Consejería Medio Ambiente y Territorio, Gobierno Islas Balear, l’Agence de l’Eau Adour Garonne France, la Région Nouvelle Aquitaine France, la Communauté d’Agglomération Pays Basque France et la Município de Faro Portugal.

Ils nous font confiance

en cours…

Un projet d’étude en biologie
moléculaire ou en environnement ?


Nos équipes développent des approches innovantes pour mieux comprendre le devenir des substances et caractériser les communautés microbiennes présentes dans les écosystèmes.

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