Biodiversité et suivi des populations

Détection des espèces rares et invasives

Les Laboratoires des Pyrénées et des Landes accompagnent les professionnels de la gestion de l’environnement dans le suivi des espèces ou invasives. En s’appuyant sur des méthodes normalisées, les LPL réalisent des analyses pour identifier génétiquement des espèces difficiles à observer (nocturnes ou sauvages), via des prélèvements de tissus, de fèces voire d’ADNe. Confirmer la présence de ces espèces peut s’avérer primordial dans la conservation des espèces menacées. À l’inverse les LPL, peuvent aussi réaliser des analyses pour identifier des espèces invasives ou en cours de colonisation pour aider els gestionnaires à orienter les décisions d’aménagement du territoire. Nos équipes pourront vous accompagner du dimensionnement de votre étude à l’interprétation des résultats.

Espèces rares ou menacées : Desman des Pyrénées, Ecrevisse à pattes blanches, Vison d’Europe, … Espèces exotiques envahissantes : Ecrevisse de Louisiane, Vison d’Amérique, Raton laveur, …

illustration Laboratoires des Pyrénées et des Landes (LPL)

Inventaire des populations


Pour protéger la biodiversité et mettre en œuvre des actions efficaces, il est primordial de connaître un milieu naturel et les espèces qui le peuplent. En cela les LPL peuvent vous aider à établir un inventaire des espèces d’un groupe taxonomique cible via de simple prélèvement d’ADN environnemental ou de piège barber non létal. 

Via la technique de séquençage de courts fragments ADN, appelé marqueurs ou codes-barres, les LPL seront capable d’établir, par exemple, la liste de poissons peuplant une rivière avant et/ou après une pollution, une réintroduction, de même qu’ils pourront vous aider dans le suivi et la dynamique temporelle des coléoptères coprophages sur les exploitations agricoles. 

Quel que soit votre domaine, les LPL restent à votre disposition pour vous accompagner et dimensionner une étude pouvant répondre à vos attentes.

Dans ce domaine les LPL s’appuient sur leur expérience dans les projets d’innovation PLACENETT et  Aqua-IA. 

Projet PLacenett (2019-2023) : Pâturages Laitiers Assistés par les Coprophages Eco-NETToyeurs. Projet finacéé par la région Nouvelle-Aquitaine en partenariat avec l’université Paul Valéry Montpellier 3, le CEDEO, l’Ecole vétérinaire de Toulouse, la Chambre d’Agriculture 64, le CPIE Pays Basque et le parc National des Pyrénées 

Projet Aqua-IA (2025-2028) : Indice macroinvertébrés par ADNe et Intelligence Artificielle : approches non létales et innovantes pour la gestion des milieux AQUAtiques. Projet financé par l’Agence de l’eau Adour-Garonne en partenariat avec Akkodis et ScimaBio Interface.

Génétique des populations


Dans la gestion des écosystèmes, comprendre la dynamique d’une population c’est permettre de suivre et d’anticiper l’affaiblissement génétique d’une population. La consanguinité, l’isolement des populations par des fractures géographiques naturelles ou anthropiques, ou encore le faible nombre d’individu d’une population peuvent conduire à une perte de patrimoine génétique et à terme aux capacités d’adaptation d’une espèce. 

Les LPL via l’analyse des microsatellites, de courtes séquences d’ADN variables d’un individu à l’autre, permettent à leur client de révéler l’état réel de la diversité génétique d’une population : niveau de diversité génétique, degré de parenté entre individus, flux de gènes, … En partenariat avec des spécialistes de l’interprétation de ces données génétiques, ce type d’analyse vous guidera dans la prise de mesures concrètes et efficaces.

Espèces déjà étudiées : Martre, Cerfs, Chevreuil, Sanglier, Hérisson, Grand Tetras.

L’expérience des LPLs dans ce domaine repose sur leur participation aux programme IN SITU, ADAPTER, CORRIDOR ou encore EFFACILT. 

Régime alimentaire


La gestion des espaces naturels passe aussi par la compréhension des besoins alimentaires d’une espèce selon les disponibilités des ressources et par celle de ses interactions avec les autres espèces (prédation, compétition ou partage des ressources). 

Avec la technique du metabarcoding, les LPL dispose des outils pour identifier les marqueurs génétiques plus ou moins fins permettant l’identification des espèces prédatées à partir de prélèvements de fèces ou de contenus stomacaux. Avant de réaliser toute analyse, notre objectif est donc de vous accompagner dans le choix de ces marqueurs pour répondre au mieux à vos questions qu’il s’agisse d’une exploration primaire du régime d’une espèce à l’identification précise des espèces potentiellement prédatés dans un environnement particulier. 

Espèces déjà étudiées : Raton Laveur, Renard, Ragondin, Œdicnème criard

Besoin de mieux connaître
les espèces présentes
sur votre territoire ?


ADNe, génétique, metabarcoding… nos experts vous accompagnent dans le choix des méthodes et l’interprétation des résultats pour éclairer vos décisions.

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